根据《第五次全国幽门螺杆菌感染处理共识》，现已明确与下列多种疾病的发病有关。
（1）非萎缩胃炎，萎缩性胃炎，淋巴细胞性胃炎等；
（2）胃溃疡，十二指肠球部溃疡；
（3）胃癌、胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤；
（4）胃少见病：增生性胃息肉、胃黏膜肥大症等；
（5）胃外疾病：缺铁性贫血、血小板减少症、维生素B12缺乏症等。
（6）有报道称心脑血管疾病、某些肝胆疾病、呼吸系统疾病、白血病、皮肤
病、口腔疾病、糖尿病等也与之相关。
Hp胃炎是一种感染性或传染性疾病，所有感染者均应得到治疗，从这一角度看似乎已不再需要根除指征。的《幽门螺杆菌胃炎京都全球共识》明确提出：除非有特殊原因，所有幽门螺杆菌感染者均应给予根除治疗。
但是，问题是，幽门螺杆菌的抗药性很强，也普遍有副作用，现有药物疗法的副作用有时会使治疗得不偿失。所以，具体情况还要具体分析。
1、首先，人一旦感染了幽门螺杆菌，100%的个体都会发生慢性胃炎，但70%以上的感染者是没有任何不适症状的，先后出现症状的只有30%左右，其中约10%表现为消化不良，15~20%发生胃、十二指肠溃疡，还有约1%的人最终发展成胃癌。
幽门螺杆菌感染还可能与冠心病、特发性血小板减少性紫癜、荨麻疹等疾病有关。
2、但一些研究也发现幽门螺杆菌并非百害而无一益，千万年来在与人类共同进化适应的过程中，幽门螺杆菌对人类也产生一些保护作用，如对哮喘、胃食管反流、肥胖等有一定预防作用。
权衡益害不难判断，即使单从胃癌预防的角度出发，一旦感染了幽门螺杆菌，原则也应该及早根除。
3、另一方面，幽门螺杆菌的抗药性是很强的，单药基本上无效，必须采用联合疗法。但随着耐药越来越严重，一次联合用药的根除成功率不断下降，更换药物、加大剂量、延长疗程、“三联疗法”变“四联疗法”也无法100%保证成功，反复治疗失败者屡见不鲜，特别是儿童、老年人及其它免疫力低下者。
但由此引发毒副作用却骤然增加，如肝肾毒性、过敏反应、菌群失调等等，药物副作用有时会让治疗得不偿失。
因此，
除非有明确症状或个人要求者，否则暂不考虑治疗。这是因为儿童免疫发育尚未成熟，根除成功率很低；而老年人不仅免疫力低、成功率同样不高，而且防癌效果也不大。
⑵对于青壮年感染，无论有无症状均应及早根除治疗。
研究证明，防癌效果在发生萎缩性胃炎之前最好。日本推荐筛查幽门螺杆菌的时段是12~20岁和婚检，显然是综合考虑了防癌效果和治疗效果后得出的结论。
⑶对于无法根除的青壮年感染者，
要告之完全不必紧张，因为幽门螺杆菌感染发展成胃癌毕竟只有少数，而且胃癌的发生也并非细菌一种因素决定，还要综合菌株类型、遗传体质、饮食、地理环境等多种因素，消除其它可控不利因素同样重要和有效。
更为关键的是，定期胃镜检查完全可以让高风险人群防患于未然。正所谓“知道了危险也就不危险了”。
我国人群中有近半数人感染了Hp，感染人口基数庞大；随着Hp耐药率的上升，根除已很不容易。因此，目前我国主动、全面筛查Hp阳性者并给予治疗并不现实。
基于利弊分析，也有专家认为：不管是否有根除指征，如无抗衡因素，一般都建议对查幽门螺杆菌阳性者进行根除治疗。
