后端开发|Python教程
python,DICOM,图像
后端开发-Python教程
DICOM（Digital Imaging and Communications in Medicine）即医学数字成像和通信，是医学图像和相关信息的国际标准（ISO 12052）。下面这篇文章主要给大家介绍了关于python对DICOM图像读取的相关资料，需要的朋友可以参考借鉴，下面来一起看看吧。
素材下载系统源码,vscode中文显示不全,ubuntu 启动加密,tomcat ajp全称,怎么在sqlite添加字段,梦见家里突然出现爬虫类,重庆培训PHP,云南seo推广软件,企易达装饰建材门户网站系统,帝国网页特效,服装企业创建模板lzw
DICOM介绍
yii2 电商源码下载,vscode 不联网打不开,ubuntu 移除硬盘,tomcat报502错误,北京常见爬虫,php5参考手册,天津seo优化关键词,asp网站版权,网站模板打包lzw
DICOM3.0图像，由医学影像设备产生标准医学影像图像，DICOM被广泛应用于放射医疗，心血管成像以及放射诊疗诊断设备（X射线，CT，核磁共振，超声等），并且在眼科和牙科等其它医学领域得到越来越深入广泛的应用。在数以万计的在用医学成像设备中，DICOM是部署最为广泛的医疗信息标准之一。当前大约有百亿级符合DICOM标准的医学图像用于临床使用。
swf影视网站源码,ubuntu修改挂载点,网络爬虫病毒形,lniux php,新站seo收录lzw
看似神秘的图像文件，究竟是如何读取呢？网上随便 一搜，都有很多方法，但缺乏比较系统的使用方法，下文综合百度资料，结合python2.7，讲解如何读取及使用DICOM图像。
读取DICOM图像，需要以下几个库：pydicom、CV2、numpy、matplotlib。pydicom专门处理dicom图像的python专用包，numpy高效处理科学计算的包，依据数据绘图的库。
安装：
pip install matplotlib
pip install opencv-python #opencv的安装，小度上基本都是要下载包，安装包后把包复制到某个文件夹下，#后来我在/pypi/opencv-python找到这种pip的安装方法，亲测可用
pip install pydicom
pip install numpy
如果没有记错，安装pydicom时，也会自动把numpy安装上。
安装好这些库后，就可以对dicom文件操作。
具体看下面代码：
#-*-coding:utf-8-*-import cv2import numpyimport dicomfrom matplotlib import pyplot as pltdcm = dicom.read_file("AT0001_100225002.DCM")dcm.image = dcm.pixel_array * dcm.RescaleSlope + dcm.RescaleInterceptslices = []slices.append(dcm)img = slices[ int(len(slices)/2) ].image.copy()ret,img = cv2.threshold(img, 90,3071, cv2.THRESH_BINARY)img = numpy.uint8(img)im2, contours, _ = cv2.findContours(img,cv2.RETR_LIST,cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)mask = numpy.zeros(img.shape, numpy.uint8)for contour in contours: cv2.fillPoly(mask, [contour], 255)img[(mask > 0)] = 255kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_ELLIPSE,(2,2))img = cv2.morphologyEx(img, cv2.MORPH_OPEN, kernel)img2 = slices[ int(len(slices)/2) ].image.copy()img2[(img == 0)] = -2000plt.figure(figsize=(12, 12))plt.subplot(131)plt.imshow(slices[int(len(slices) / 2)].image, gray)plt.title(Original)plt.subplot(132)plt.imshow(img, gray)plt.title(Mask)plt.subplot(133)plt.imshow(img2, gray)plt.title(Result)plt.show()
在DICOM图像里，包含了患者的相关信息的字典，我们可以通过dir查看DICOM文件有什么信息，可以通过字典返回相关的值。
import dicomimport jsondef loadFileInformation(filename): information = {} ds = dicom.read_file(filename) information[PatientID] = ds.PatientID information[PatientName] = ds.PatientName information[PatientBirthDate] = ds.PatientBirthDate information[PatientSex] = ds.PatientSex information[StudyID] = ds.StudyID information[StudyDate] = ds.StudyDate information[StudyTime] = ds.StudyTime information[InstitutionName] = ds.InstitutionName information[Manufacturer] = ds.Manufacturer print dir(ds) print type(information) return informationa=loadFileInformation(AT0001_100225002.DCM)print a
总结
