硬盘用NTFS ,大容量的闪存(一般>4G)才使用exFAT。exFAT(Extended File Allocation Table,又名FAT64)是一种特别适合于闪存驱动器的档案系统,最先从微软的Windows Embedded CE 6.0导入这种档案系统,再延伸到后来的Windows Vista Service Pack 1桌面操作系统中。由于NTFS档案系统的一些数据格式规定所限,对闪存驱动器而言exFAT档案系统显得更见优势。exFAT比过去的FAT文件系统的优势在于:可扩展至更大磁盘大小 理论的文件大小限制为264字节(16 exbibytes),限制由232字节(4 gibibytes在FAT32) 簇集大小最大可为每扇区2255字节,最大 32 MB 由于采用了空余空间寻址,空间分配和删除的性能得以改进 在单一文件夹内支援超过216个档案 支援访问控制列表(但在Windows Vista SP1中尚未支援)支援Transaction-Safe FAT档案系统 (TFAT)(在WinCE中可选的功能) 提供给OEM的可定义参数可以使这个文件系统适应有不同特点的设备。 时间戳记能够使用UTC时间而不仅仅是本地时区(从Vista SP2开始) 此外,exFAT比NTFS需要较少的磁盘空间开销;试验发现,4GB的闪存驱动器格式化为NTFS使用472MB磁盘空间的开销,而使用exFAT则为96KB。
exFAT比过去的FAT文件系统的劣势在于:某些设备(如PDA、DC)将无法使用exFAT格式的闪存卡。 使用exFAT的设备将不能够使用 Windows Vista的ReadyBoost功能。(Windows 7中的新的exFAT系统支持ReadyBoost 授权方式不明确。不过,微软曾经为FAT文件系统的一部分申请过专利用户可以在Windows XP上添加支援exFAT的修补程序。 NTFS是Windows NT以及之后的Windows 2000、Windows XP、Windows Server 、Windows Server 、Windows Vista和Windows 7的标准文件系统。NTFS取代了文件分配表(FAT)文件系统,为Microsoft的Windows系列操作系统提供文件系统。NTFS对FAT和HPFS(高性能文件系统)作了若干改进,例如,支持元数据,并且使用了高级数据结构,以便于改善性能、可靠性和磁盘空间利用率,并提供了若干附加扩展功能,如访问控制列表(ACL)和文件系统日志。该文件系统的详细定义属于商业秘密,但 Microsoft 已经将其注册为 知识产权产品。