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win10安装GDCM以期用pydicom读取jpeg无损压缩过的DICOM文件

时间:2022-02-08 00:45:28

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win10安装GDCM以期用pydicom读取jpeg无损压缩过的DICOM文件

可以通过查看DICOM以下Tag来判断DICOM文件是否压缩过

可以通过RadiAnt查看DICOM文件以下Tag来判断该DICOM文件是否被压缩过:

由上图可知,该DICOM做过JPEG无损压缩,为了让pydiom能读取该DICOM文件,需要安装GDCM:

1. 到/malaterre/GDCM/releases下载最新版的安装包

GDCM-3.0.9-Windows-x86_64.exe,安装好GDCM;

2. 把GDCM安装目录下的lib文件夹下的gdcm.py, gdcmswig.py, _gdcmswig.pyd这三个文件拷贝到C:\software\Anaconda3\DLLs目录下;

3. 安装依赖包:

pip3 install pylibjpeg pylibjpeg-libjpeg

大功告成!

另外,其实用SimpleITK也可以直接读取压缩过的DICOM文件的。

参考链接:

/article/TracelessLe/84619861

/questions/49297078/how-to-install-gdcm-python-wrapping-on-windows-system

https://pydicom.github.io/pydicom/dev/old/image_data_handlers.html

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