对接的过程中会考虑如下因素：
形状互补亲疏水性表面电荷分布
两种蛋白质-蛋白质分子对接：
Rigid Docking 刚性对接–目前可用的大多数软件为刚性对接。Flexible Docking 柔性对接–计算量大，可用软件少，且多为收费软件。
蛋白质相互作用常用对接软件
ZDOCKGRAMM-X
输出值都为多个对接状态（根据能量高低排序，能量低的排名靠前）。结果可用VMD查看。
文章来源：公众号：科研讨论圈
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