设要做二因素的正交设计，A因素有三个水平，B因素有两个水平。则选择Data-->Orthogonal Design-->generate，弹出的就是正交设计窗口：
Factor name框：输入A：单击ADD钮：单击Define value钮：分别在Value列的头三行输入1、2和3，单击continue钮，这样就定义好了变量A。
按类似的方法定义好变量B的2个水平。单击OK，系统就输出一个新定义的数据集，前两个变量就是要分析的A和B，各个水平已经按正交设计的要求排列好了。后面的status_和card_变量是系统产生的LOG变量，可以不管它。现在你再建立一个结果变量，输入实验结果，就可以进行正交设计的分析了。
正交设计的分析用GLM模块进行。具体操作如下： Analyze->General Linear Model->Univariate... dependent中选入应变量，fixed factor中选入自变量。然后进入model钮进行模型设置，这一步非常重要！设置模型为custom，然后选择需要分析的主效应和交互作用。然后确认，就可以得到所需要的结果。
请注意，如果model钮进行模型设置时选择错误，则得到的结果肯定是不正确的。
