职级上和权限上都有差别。
副主任，是单位的副职领导，由上级单位任命主任助理的职级属下属单位的正职级别，或略高一点。
副主任，在单位根据分工会负责某些工作，分管一些部门。
主任助理，一般协助副主任管理某些工作，当然也有行使副主任职务的。
主任助理提拔为副主任概率很大。
主任助理和副主任的区别
主任助理与副主任虽然都是协助主任开展工作，但两者之间区别明显。
一是从行政级别上来说，主任助理并在当然且有与副主任同等级别，如果没有特别注明，主任助理可能低于副主任
二是主任助理多是过渡性职务安排，具有考察试用的性质，大多一年左右会任命为副主任或相当的职务。
