1、施肥浅或表施，肥料易挥发、流失或难以到达作物根部，不利于作物吸收，造成肥料利用率低。肥料应施于种子或植株侧下方10～16cm处。
2、农作物施用化肥不当，可能造成肥害，发生烧苗、植株萎蔫等现象。例如，一次性施用化肥过多或施肥后土壤水分不足，会造成土壤溶液浓度过高，作物根系吸水困难，导致植株萎蔫，甚至枯死。
3、过多地使用某种营养元素，不仅会对作物产生毒害，还会妨碍作物对其他营养元素的吸收，引起缺素症。例如，施氮过量会引起缺钙，硝态氮过多会引起缺钼失绿；钾肥过多会降低钙、镁、硼的有效性；磷过多会降低钙、锌、硼的有效性。
4、鲜人粪尿不宜直接用于蔬菜。新鲜人粪尿中含有大量的病菌、毒素和寄生虫卵，如果未经腐熟而直接施用，会污染蔬菜，易传染疾病，需经高温堆沤发酵或无害化处理后才能施用。未腐熟的畜禽粪便在腐烂的过程中会产生大量的硫化氢等有害气体，易使蔬菜种子烧种或发生根腐病，不利于蔬菜种子萌芽生长。
为防止肥害的发生，生产上应注意合理施肥。一是施有机肥，提高土壤缓冲能力；二是按规定施用化肥。不随意加大施肥量，追肥掌握轻肥勤施的原则。三是全层施肥。同等数量的化肥，在局部施用时往往造成土壤溶液浓度急剧升高，伤害作物根系，改为全层施肥，让肥料均匀分布于整个耕层，能使作物避免伤害。
