西瓜枯萎病是由半知菌亚门真菌，西瓜尖镰孢菌侵染所致。病菌在土壤中和未腐熟的带菌肥料中越冬，在离开寄主的情况下，能存活5－6年，部分病菌可存活以上。
西瓜枯萎病的发病规律，病菌主要以菌丝、厚垣孢子或菌核在未腐熟的有机肥或土壤中越冬。病菌可通过种子、肥料、土壤、浇水传播。以堆肥、沤肥传播为主要途径。病害发生与温、湿度关系密切。病菌生长温度为5-35℃，土温24-30℃为病菌萌发和生长适宜温度。该病为土传病害，发病程度取决于土壤中可侵染菌量。一般连茬种植，地下害虫多，管理粗放，或土壤粘重，潮湿等病害发生严重。病菌从根顶端附近的细胞间隙侵入，边增殖边到达中心柱产生毒素，堵塞导管，破坏根组织，阻碍水分通过。连续降雨后，天气晴朗，气温迅速上升时，发病迅速。
西瓜枯萎病各个时期均可发生，以结果期发病最重。其病菌适宜温度在25－30℃，土温低于23℃，高于34℃，发病则轻，土壤含水量高，湿度大时发病重。该病主要靠含菌土壤传播，重茬种植，土壤中病菌多，病株率可达70%左右，病残体及病粪，种子亦可传病。
