病原菌在稻田中越冬,为初侵染源。春耕灌水时,越冬菌核与浮屑、浪渣混杂漂浮在水面上,黏附在稻株上进行侵染,形成病斑。
水稻纹枯病属高温高湿性病害，氮肥多，密度大发病重。
多数情况下高温多湿易感病。
在稻田土壤里或稻行、杂草中越冬的菌核，于第二年春耕灌水时浮于，炽附在稻株基部的叶鞘上。当温湿条件适宜时，菌核萌发长出菌丝，直接侵入叶鞘，病斑不断扩大蔓延，病部的菌丝体集结形成菌核，落入水中，随水流扩大传播。水稻生长前中期，病害主要在稻株基部叶鞘横向扩展。抽穗以后，在温湿条件适宜情况下，病害很快向上面的叶鞘、叶片侵染扩展。大水稻生长的一生中，分蘖期、孕穗期至抽穗期抗病能力降低，病菌侵染最快。当湿度大，气温30oC左右时，只要1天－2天菌核就能萌发长出菌丝，7天左右双可形成新的菌核。
水稻纹枯病病菌侵染水稻茎基部，形成云纹状病斑。
春耕灌水时,越冬菌核与浮屑、浪渣混杂漂浮在水面上,黏附在稻株上进行侵染,形成病斑。病斑上的病菌通过接触侵染邻近稻株而在稻丛间蔓延。病部形成的菌核落入田中随水漂浮,进行再侵染。抽穗前病部新生菌丝以横向蔓延为住,抽穗后主要沿稻秆表面向上部叶鞘、叶片蔓延侵染,孕穗至抽穗期侵染最快,抽穗至乳熟期单株病害向上蔓延最快。早稻菌核成为晚稻主要病源。
高温、高湿，时雨时晴是水稻纹枯病发的诱因。
水稻纹枯病又称云纹病，俗名花足秆、烂脚瘟、眉目斑。是由立枯丝核菌感染得病，多在高温、高湿条件下发生。纹枯病在南方稻区为害严重，是当前水稻生产上的主要病害之一。该病使水稻不能抽穗，或抽穗的秕谷较多，粒重下降。
水稻纹枯病发病时在叶片和茎杆上出现像开水烫过的椭圆形病斑，常常相互合并成不规则的云纹状斑，其边缘为褐色，中部灰绿色或淡褐色。
