性质不同（教育硕士是我国开设的全日制专业硕士学位之一，教育学硕士是学术型研究生）；注重点不同（教育硕士注重实践性和应用性，教育学硕士侧重理论研究）；培养目标不同（教育硕士培养在专业和专门技术上受到正规的、高水平训练的高层次人才，教育学硕士培养大学教师和科研机构的研究人员等）。
教育硕士是我国开设的全日制专业硕士学位之一，简称专业学位。专业学位，是相对于学术型学位而言的学位类型，其目的是培养具有扎实理论基础，并适应特定行业或职业实际工作需要的应用型高层次专门人才。
教育学硕士是学术型研究生，专业学位与学术型学位处于同一层次，但培养规格各有侧重，在培养目标上有明显差异。学术型学位按学科设立，其以学术研究为导向，偏重理论和研究，培养大学教师和科研机构的研究人员等。
