水产养殖同畜禽养殖最大的不同在于，水产动物的吃喝撒全在水里解决，而畜禽养殖中能够人为的清理排泄物，保障环境的相对清洁。
畜禽养殖可以自动清粪
以对虾为例，其对饲料的利用率仅有30%左右，将近70%的有机物以粪便、残饵等形式沉积于池塘中。这些残存的物质很难通过人为方式干预排出，有大量换水条件的除外，然而，大排大换水的方式也难以持续，整个水源都被污染，养殖难度越来越高。
70%的有机物成为水质恶化的原因
目前而言，水产养殖中是否拥有高效、有益的分解者直接关系到养殖的成败。分解者即微生物，水产上应用的微生物制剂种类繁多，质量也是参差不齐，鉴于此，本文对水产用益生菌关键要素进行一下讲述：1、产品中活菌数要足够。对于液体剂型而言，最大的问题就是保质期短。大家可以想想，咱们喝的酸奶、乳酸菌饮料保质期一般为30天，且需要4度冷藏，以此为例看下水产相关产品的保质期、保藏条件，其中所含的活菌有多少自然也就清楚了。然而，乳酸菌类、光合细菌还是推荐应用液体，主要是因为这两类菌不耐高温，需要通过冻干才能做出菌粉，一般来说，冻干乳酸菌粉价格约为100-300元/kg。因此，推荐应用液体产品，如前所述，液体乳酸菌不耐保存，常温放置3个月活菌一般降低500-1000倍左右。好的方面是，这两类益生菌都比较适合养殖户自扩培，可降低成本、保证菌种活力；粉剂产品中，推荐应用芽孢杆菌类。在产品中一般以芽孢的形态存在，非常耐保存，常温存放一年都没有问题。不过建议使用前活化一下，使孢子转化为有活力的营养体，以便发挥最好效果。可应用红糖1：1，30度，活化2-4小时。
芽孢孢子：含水量低、抗逆性强。图片引自科学网
2、应用位点维持优势活菌水平。显而易见，选用池塘或水产动物肠道的土着菌群可满足这一要求（这里可不讲外来的和尚会念经）。不过现在的产品中基本上很难判断是否为土着菌，就益生菌而言，建议：水体中发挥作用的活菌数不低于10万个/ml，拌料内服发挥作用的活菌数不低于100万个/g，只有达到这个活菌浓度才能够占据优势水平，发挥抑制病原菌、分解有害物质的作用。
肠道表面微生物菌群，图片源自网络
3、益生菌能够产能功能性代谢产物。功能性代谢产物是益生菌发挥作用的关键因素。如降解亚硝酸盐、氨氮的菌制剂，这直接同其脱氮酶系活性相关；如微生物的分解、改底功效，这同其产生的淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶及非淀粉多糖酶等胞外酶息息相关，再如微生物的抑菌效果，这直接同微生物产生的溶菌酶、细菌素、过氧化氢等相关；另外，海洋红酵母等的营养功能，直接同产生的虾青素、维生素等有关。可见，代谢产物是微生物诸多功能的体现者。所以不仅需要百千万个微生物能够存活，还需要有功能性，正所谓有量还要有质（下图）。
水产益生菌关键要素图
所以，在选择益生菌的时候，一定要多个心眼。要考量一下是哪个功能菌，即菌株。现在市面上的微生态制剂主要有芽孢杆菌、乳酸菌、酵母菌及光合细菌等，这些名称都是科、属的大概念，像枯草芽孢杆菌、粪肠球菌、沼泽红假单胞菌、海洋红酵母是菌种的范畴，而微生态制剂真正发挥作用的是菌株层面（也就是某个菌种里的特定一个具有某些功能的个体。举个例子，比如说同样是狗（地衣芽孢杆菌），有些是京巴，有些是藏獒，当然藏獒更厉害了（不同菌株））。所以我们选用菌制剂不光要看菌种，更要关注这个产品里菌株具体的功能是否合适，这点非常关键。
