南海I号沉船遗址位于广东省上下川岛附近海域，1987年8月被发现，当时打捞出了二百多件宋代瓷器和银锭、铜钱等物。后由国家博物馆水下考古研究中心牵头组成“南海I号水下考古队”，进行4次大规模勘探和试掘，进一步确定了沉船遗址的精确位置及性质、年代；基本掌握了沉船长、宽、高和保存状况的基本数据。
辽宁绥中三道岗元代沉船发掘
绥中三道岗元代沉船的调查和发掘是已进行的水下考古工作中历时最长、投入人力物力最多的一项重点工作。1991年确认沉船遗址位置后，1992—1997年，中国历史博物馆水下考古学研究中心对沉船遗址先后实施了六个夏季较大规模的调查和发掘。沉船距今740年±80年。出水遗物以磁州窑瓷器为主。
西沙群岛水下文物抢救发掘
在国家文物局的直接领导下，由中国历史博物馆水下考古学研究室（现国家博物馆水下考古研究中心）牵头，于1998年12月至1999年1月，以西沙群岛北礁海域为主要调查地点，共发现五代至清代各个年代的水下文物遗存13处，近代遗存1处。出水文物标本共计1500余件，以瓷器为主，还有少量铁器、铅锡、象牙、船板等。
福建平潭碗礁一号清代沉船调查发掘
东海平潭碗礁一号沉船，因出水了大批清代康熙时期景德镇生产的外销瓷器而引起了广泛的关注。遗址位于福建福州平潭屿头乡碗礁。沉船遗物主要以瓷器为主，瓷器为清代康熙中期景德镇民窑产品，累计出水17000余件。
西沙群岛华光礁一号南宋沉船发掘
华光礁一号沉船遗址位于西沙群岛华光礁环礁内，1996年由渔民发现，1998年国家博物馆和海南省文物部门做过初步的试掘工作，出水文物近1000余件，绝大部分是青白釉瓷器，间或有褐釉、白釉系器物，从产地上看均来自于福建闽南一带的民间窑场，年代属南宋。
