一、允许加计扣除的研发费用
财税[]13号规定，企业在试点地区内从事《国家重点支持的高新技术领域》、国家发展改革委等部门公布的《当前优先发展的高技术产业化重点领域指南(度)》和试点地区当前重点发展的高新技术领域规定项目的研究开发活动，其在一个纳税年度中实际发生的下列费用支出，允许在计算应纳税所得额时按照规定实行加计扣除：
1.新产品设计费、新工艺规程制定费以及与研发活动直接相关的技术图书资料费、资料翻译费。
2.从事研发活动直接消耗的材料、燃料和动力费用。
3.在职直接从事研发活动人员的工资、薪金、奖金、津贴、补贴，以及依照国务院有关主管部门或者其所在省级人民政府规定的范围和标准为在职直接从事研发活动人员缴纳的基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费和住房公积金。
4.专门用于研发活动的仪器、设备的折旧费或租赁费以及运行维护、调整、检验、维修等费用。
5.专门用于研发活动的软件、专利权、非专利技术等无形资产的摊销费用。
6.专门用于中间试验和产品试制的不构成固定资产的模具、工艺装备开发及制造费，以及不构成固定资产的样品、样机及一般测试手段购置费。
7.勘探开发技术的现场试验费，新药研制的临床试验费。
8.研发成果的论证、鉴定、评审、验收费用。
企业根据财务会计核算和研发项目的实际情况，对发生的研发费用进行收益化或资本化处理的，可按下列规定计算加计扣除：
(1)研发费用计入当期损益未形成无形资产的，允许再按其当年研发费用实际发生额的50%，直接抵扣当年的应纳税所得额。
(2)研发费用形成无形资产的，按照该无形资产成本的150%在税前摊销。除法律另有规定外，摊销年限不得低于。
二、不得实行加计扣除的研发费用
根据相关规定，以下四种情行的研发费用不得实行加计扣除：
1.对企业委托给外单位进行开发的研发费用，由委托方按照规定计算加计扣除，受托方不得再进行加计扣除。对委托开发的项目，受托方应向委托方提供该研发项目的费用支出明细情况，否则，该委托开发项目的费用支出不得实行加计扣除。
2.法律、行政法规和财政部、国家税务总局规定不允许在企业所得税前扣除的费用和支出项目，均不允许计入研究开发费用。
3.企业未设立专门的研发机构或企业研发机构同时承担生产经营任务的，应对研发费用和生产经营费用分开进行核算，准确、合理的计算各项研究开发费用支出，对划分不清的，不得实行加计扣除。
4.企业申报的研究开发费用不真实或者资料不齐全的，不得享受研究开发费用加计扣除，主管税务机关有权对企业申报的结果进行合理调整。主管税务机关对企业申报的研究开发项目有异议的，可要求企业提供省级科技部门出具的研究开发项目鉴定意见书。
三、研究开发费用加计扣除操作注意事项
研究开发费用加计扣除的注意事项主要有：
1.企业必须对研究开发费用实行专账管理，同时必须按照财税[]13号附表的规定项目，准确归集填写年度可加计扣除的各项研究开发费用实际发生金额。企业在一个纳税年度内进行多个研究开发活动的，应按照不同研发项目分别归集可加计扣除的研究开发费用额。
2.企业应于年度终了办理企业所得税汇算清缴申报时向主管税务机关报送财税[]13号规定的各项资料。企业可以聘请具有资质的会计师事务所或税务师事务所，出具年度可加计扣除研究开发费用专项审计报告或鉴证报告。
3.企业申请研究开发费用加计扣除时，应向主管税务机关报送如下资料：
(1)自主、委托、合作研究开发项目计划书和研究开发费预算。
(2)自主、委托、合作研究开发专门机构或项目组的编制情况和专业人员名单。
(3)《研发项目可加计扣除研究开发费用情况归集表》、《企业年度研究开发费用汇总表》。
(4)企业总经理办公会或董事会关于自主、委托、合作研究开发项目立项的决议文件。
(5)委托、合作研究开发项目的合同或协议。
(6)主管税务机关要求提供科技部门鉴定意见的，应提供省级科技部门出具的《企业研究开发项目鉴定意见书》。
(7)研究开发项目的效用情况说明、研究成果报告等资料。
4.企业实际发生的研究开发费用，在年度中间预缴所得税时，允许据实计算扣除，在年度终了进行所得税年度申报和汇算清缴时，再依照财税[]13号的规定实行加计扣除。
5.企业研究开发费用各项目的实际发生额归集不准确、汇总额计算不准确的，主管税务机关有权调整其税前扣除额或加计扣除额。
6.企业集团根据生产经营和科技开发的实际情况，对技术要求高、投资数额大，需要由集团公司进行集中开发的研究开发项目，其实际发生的研究开发费用，可以按照合理的分摊方法在受益集团成员公司间进行分摊。
7.企业集团采取合理分摊研究开发费用的，企业集团应提供集中研究开发项目的协议或合同，该协议或合同应明确规定参与各方在该研究开发项目中的权利和义务、费用分摊方法等内容。如不提供协议或合同，研究开发费用不得加计扣除。
8.企业集团采取合理分摊研究开发费用的，企业集团集中研究开发项目实际发生的研究开发费，应当按照权利和义务相一致、费用支出和收益分享相配比的原则，合理确定研究开发费用的分摊方法。
9.企业集团采取合理分摊研究开发费用的，企业集团母公司负责编制集中研究开发项目的立项书、研究开发费用预算表、决算表和决算分摊表。
10.税企双方对企业集团集中研究开发费用的分摊方法和金额有争议的，如有关企业集团成员公司分别设在不同省、自治区、直辖市、计划单列市的，企业按照国家税务总局的裁决意见扣除实际分摊的研究开发费用;有关企业集团成员公司均设在统一省、直辖市的，企业按照其所在省、直辖市税务机关的裁决意见扣除实际分摊的研究开发费。
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