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BRCA1 BRCA2基因突变的检测方法与流程

时间:2020-10-01 06:43:51

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BRCA1 BRCA2基因突变的检测方法与流程

BRCA1/2基因突变的检测方法与流程

BRCA1和BRCA2均属肿瘤抑制基因,BRCA1/2编码的蛋白作用于多种细胞生命活动过程,包括DNA损伤修复、基因转录调控和细胞周期调节等。BRCA基因编码蛋白通过同源重组(homologous recombination)参与DNA双链 (dsDNA)损伤修复,BRCA1/2基因突变乳腺癌患者由于同源重组修复功能缺陷,可能对铂类或多聚(ADP-核糖)聚合酶[ poly ( ADP-ribose ) polymerase, PARP ]抑制剂等致DNA损伤药物更为敏感。

检测BRCA1和BRCA2基因突变

检测BRCA1和BRCA2基因突变的方法,其包括以下步骤:

(1)提取全血dna;(外周血dna)

(2)利用上述检测brca1/2基因突变的引物组合物通过多重pcr扩增目标区域;

(3)扩增产物构建文库;(构建文库建库按照illumina标准建库流程进行)

(4)高通量测序;(测序平台为illumina测序平台)

(5)测序结果处理及分析。(测序读段结果与人类基因组hg19进行比对,得到读段在参考基因组上的位置,使用gatk软件分析变异位点和插入缺失序列情况,vep软件注释)

当待测的dna分子来自多个受试样品时,每个样品的扩增产物在构建文库时可以被加上不同的标签序列(barcode),以在测序过程中进行

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